最近Nucleic Acids Research杂志在线发表了首个人类血液外泌体长链RNA数据库exoRBase（www.exoRBase.org），收录了上万条环状RNA（circRNA）、长链非编码RNA（lncRNA）和mRNA。该数据库由上海复旦大学附属肿瘤医院/肿瘤研究所（复旦肿瘤所）黄胜林课题组完成，这是该课题组继2015年Cell Research首次报道环状RNA富集于外泌体并存在于血液中的工作延续。

外泌体是近年的研究热点，作为纳米级别的小囊泡却有强大的功能和应用前景，特别是存在于体液中，是目前液体活检关注的重要领域。外泌体是由活细胞分泌的，包裹着细胞来源的核酸和蛋白等活性分子，具有介导细胞间的通讯等作用，由于携带了反映来源细胞的特异性信息，是理想的生物标志物。长链RNA包括mRNA、lncRNA和circRNA等，这些RNA数量多且存在很多组织细胞特异表达信息，以往认为它们主要在细胞内，不会存在于体液中（体液中存在很多RNA酶），近年发现它们可能被外泌体包裹释放到体液中，可作为外泌体RNA在疾病中的诊断标志物或功能靶点。与以往研究较多的miRNA相比，长链RNA数量远远大于miRNA（血液miRNA不足1000个），而且可能携带来源细胞的特异性信息，对外泌体长链RNA的研究正越来越受关注。黄胜林课题组在前期基础上，改进并完善了血液外泌体长链RNA的高通量测序方法，通过对正常人和不同疾病外泌体RNA的测序分析，发现血液外泌体存在着几万条的环状RNA、长链非编码RNA和mRNA。exoRBase正是基于这些分析基础上建立，旨在收录正常人和不同疾病患者血液外泌体里所有的长链RNA信息及其表达特征。

来源：生物谷

供稿：公共卫生处