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科学家研究发现全基因组CRISPR-Cas9筛选确认癌症治疗优先考虑的靶点

日期:2019-04-23 来源:本站 供稿:产业发展处 作者:管理员 类别:译文

癌症病人体内肿瘤分子的特性决定了能否采用靶向治疗方案,从而提高治疗效果和降低毒副作用。由于对潜在的治疗靶点认识不足,很多病人都无法使用靶向治疗方案。当前CRISPR-Cas9 基因编辑技术在生命科学领域已经得到了广泛应用。英国维康桑格研究所科学家团队Mathew J. Garnett与Kosuke Yusa2019年4月10日在Nature发表了Priorization of cancer therapeutic targets using CRISPR-Cas9 screens研究论文。

该研究通过对324种肿瘤细胞系进行基因组范围的CRISPR-Cas9细胞功能筛选,整合分析,可以优先锁定潜在的癌症治疗靶点。为了辨别339种肿瘤细胞系的18009个基因哪些是特定环境下的功能基因,哪些是发挥核心作用的基因,研究人员通过建立统计模型ADaM确定独立细胞系所需要的最少核心作用基因的数目。由此确定的肿瘤核心作用基因与之前提到的核心作用基因相比,哪个对重要的细胞进程需要承载发挥更多的基因功能。随后研究人员建立了一种特定的计算模型框架,将特定环境下的功能基因通过CRISPR-Cas9的方法或基因生物标记筛选,锁定了维尔纳综合征 ATP依赖性解旋酶(WRN)是针对肿瘤微卫星不稳定性的重要治疗靶点,为癌症治疗靶点筛选方法的应用和推广奠定了基础。

该成果生动地展示出CRISPR-Cas9筛选癌症基因作为药物靶点并通过计算基因组学的方法辅助确认哪些基因应当优先作为抗肿瘤药物靶点,从而推动了药物研发初期阶段的进程,对于开发多样化、更加有效的新抗癌药物具有重要现实意义。

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